Эндоскопическое отделение расположено в двух стационарах - терапевтическом и хирургическом. На ул. Котовского открыто в 1978 году, на Ю. Семовских работает с 2001 г.
Оснащено современным оборудованием ведущих мировых производителей эндоскопической техники.
Ежегодно врачами отделения выполняется порядка 11 000 эндоскопических вмешательств.
Сотрудники регулярно повышают уровень знаний, посещают научные конференции и мастер-классы.